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高通量染色体构象捕获(High-throughput chromosome conformation capture, Hi-C)技术是一项可用于研究基 因组三维结构的新兴技术,自2009年出现之后被广泛应用于细菌、酵母、拟南芥、水稻、小鼠及人类基因组研究中。 通过生物信息学分析,能够在全基因组范围内获得不同区域间空间靠近而发生的相互作用,研究不同物种基因组 空间结构(compartment、TAD、loop结构),从而展示肿瘤/疾病的基因组三维结构,与WGS、RNA-seq、ATAC-seq、 CUT&Tag等多组学联合分析,解析肿瘤/疾病的发生发展机制。

名称:Hi-C基因组测序
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技术原理

Hi-C技术源于染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture—3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息学方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系;通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息,并与ATAC-seq、ChIP-seq、基因组、转录组等数据联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。


生信分析

分析内容=标准分析+高级分析。

构建染色体跨度单体型,基于全基因组的互作信息,获得高分辨率

的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。

此外,还可结合转录组,重测序和ChIP-seq数据进行联合分析,从碱基变化、

基因表达、蛋白修饰及染色体三维构象分析等多方面深入探讨生物学问题。

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